Characterization of halotolerant bacillus species isolated from salt samples collected from leather factories in Turkey / E. Yilmaz in JOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA), Vol. CXIV, N° 4 (04/2019)  

[article]  inJOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA) > Vol. CXIV, N° 4 (04/2019) . - p. 118-130 Titre : Characterization of halotolerant bacillus species isolated from salt samples collected from leather factories in Turkey Type de document : texte imprimé Auteurs : E. Yilmaz, Auteur ; Meral Birbir, Auteur Année de publication : 2019 Article en page(s) : p. 118-130 Note générale : Bibliogr. Langues : Américain (ame) Catégories : Bactéries -- Comptage Bactéries -- Identification Caractérisation Contamination microbienne Cuirs et peaux -- Conservation Cuirs et peaux -- Séchage Numération pH -- Mesure Sels -- Teneur en humidité Index. décimale : 675 Technologie du cuir et de la fourrure Résumé : Salt curing is the method most commonly utilized in the leather industry to prevent microbial growth on raw hides/skins. Despite this processing, a wide diversity of microorganisms belonging to Domains Bacteria and Archaea have nevertheless been observed on salted hides/skins. In order to understand whether halotolerant bacterial species in salt contaminate hides/skins during the curing process, 30 salt samples collected from 14 leather factories in Corlu and Tuzla (Turkey) were examined for halotolerant bacteria. Total counts of halotolerant bacterial numbers, pH values and moisture contents of the salt samples were respectively determined between 104 CFU/g and 106 CFU/g, 6.23 and 7.22, 0.90 and 5.02. All isolates were able to grow on both Nutrient Agar Medium without NaCl and Nutrient Agar Medium containing NaCl at concentrations ranging from 2 to 10%. The microorganisms isolated from the samples were identified using phenotypic characteristics and comparative partial 16S rRNA gene sequence analysis. The phylogenetic analysis, using more than 1300 base comparisons of 16S rRNA sequence data, revealed 83 halotolerant isolates that share highly similar identities (97.82-100%) with their closest phylogenetic relatives. These isolates were assigned to 12 different Bacillus species (B. amyloliquefaciens, B.atrophaeus, B.halotolerans, B.licheniformis, B.mojavensis, B.paralicheniformis, B.pumilus, B.safensis, B.siamensis, B.subtilis, B.tequilensis, B.velezensis). We detected catalase and protease activities, as well as production acid from fructose, in all Bacillus isolates. Fifty-five isolates demonstrated positive oxidase activities, and 50 isolates utilized citrate as a sole carbon source. While a fairly high percentage of the isolates produced acid from maltose, almost half of the isolates produced acid from myo-inositol. While 67% of the salt samples contained 1-2 different Bacillus species, 33% of the salt samples contained 3-4 different Bacillus species. Although B.amyloliquefaciens, B.atrophaeus, B.safensis, B.siamensis species were detected at a few salt samples, B.paralicheniformis and B.halotolerans species were detected at more than half of the salt samples. These results uphold the hypothesis that proteolytic halotolerant Bacillus species in the curing salts may contaminate hides/skins during curing process. Hence, we recommend sterilized salts be used in the preservation of the hides/skins to prevent economic losses in the leather industry. Note de contenu : - Salt sample collection - Detection of total counts of halotolerant bacterial numbers in salt samples and isolation of bacillus strains - Determination of pH values of the salp samples - Determination of moisture content of the salt samples - Examination of mobility of bacillus species - Gram staining procedure of bacillus isolates - Endospore staining of bacillus species - Salt tolerance of bacillus isolates - DNA extraction and PCR amplification of bacillus isolates - Oxidase activity of bacillus isolates - Catalase activity of bacillus isolates - Protease activity of bacillus isolates - Citrate utilization by bacillus isolates - Acid production from maltose, fructose and my-inositol by bacillus isolates En ligne : https://drive.google.com/file/d/1d7a8soq83A8ZpWlsxP7y2vaapbUsrRQP/view?usp=drive [...] Format de la ressource électronique : Pdf Permalink : https://e-campus.itech.fr/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=32273 [article]

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Determination of minimum inhibitory concentrations of sophorolipids against selected halotolerant and moderately halophilic bacteria, and extremely halophilic archaea isolated from salt samples and salted skins / R. D. Ashby in JOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA), Vol. CXIX, N° 8 (08/2024)  

[article]  inJOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA) > Vol. CXIX, N° 8 (08/2024) . - p. 339-348 Titre : Determination of minimum inhibitory concentrations of sophorolipids against selected halotolerant and moderately halophilic bacteria, and extremely halophilic archaea isolated from salt samples and salted skins Type de document : texte imprimé Auteurs : R. D. Ashby, Auteur ; Meral Birbir, Auteur ; P. Yilmaz, Auteur ; J. Msanne, Auteur ; Antonio Ventosa, Auteur ; E. Yilmaz, Auteur Année de publication : 2024 Article en page(s) : p. 339-348 Note générale : Bibliogr. Langues : Américain (ame) Catégories : Antimicrobiens Archées Les archées ou Archaea, "originel, primitif", anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries. D'apparence souvent semblable à ces dernières, les archées ont longtemps été considérées comme des bactéries extrêmophiles particulières, jusqu'à ce que les recherches phylogénétiques sur les procaryotes, commencées en 1965, aboutissent, avec les travaux de Carl Woese et George E. Fox, à la publication en 1977 d'un arbre phylogénétique fondé sur les séquences des gènes d'ARN ribosomique des organismes étudiés, arbre dans lequel les procaryotes étaient scindés en deux domaines distincts, celui des bactéries et celui des archées. (Wikipedia) Bactéries Concentration minimale inhibitrice (antimicrobiens) En microbiologie, la concentration minimale inhibitrice (CMI) est la plus faible concentration d'un produit chimique, généralement un médicament, qui empêche la croissance visible d'une ou de plusieurs bactéries. La CMI dépend du micro-organisme considéré, de l'être humain affecté (in vivo uniquement) et de l'antibiotique lui-même. La CMI est déterminée en préparant des solutions du produit chimique in vitro à diverses concentrations croissantes, en incubant les solutions avec des groupes séparés de bactéries en culture et en mesurant les résultats en utilisant une méthode de dilution standardisée (agar ou microdilution). Les résultats se classent ensuite comme "sensible", "intermédiaire" ou "résistant" à un antimicrobien particulier en utilisant un point d'arrêt. Les points d'arrêt sont des valeurs convenues, publiées dans les directives d'un organisme de référence, comme le US Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), la British Society for Antimicrobial Chemotherapy (BSAC) ou le Comité européen sur les tests de sensibilité aux antimicrobiens (EUCAST). On a pu constater des écarts importants au niveau des points d'arrêt de divers pays européens au fil des ans, et entre ceux de l'EUCAST et du CLSI. Alors que la CMI est la concentration la plus faible d'un agent antibactérien nécessaire pour inhiber la croissance visible, la concentration bactéricide minimale (CBM) est la concentration minimale d'un agent antibactérien qui entraîne la mort bactérienne. Plus la CMI est proche de la CBM, plus le composé est bactéricide. La première étape de la découverte d'un médicament est souvent le dépistage d'un médicament candidat de banque de données pour les CMI contre les bactéries d'intérêt. En tant que tels, les CMI sont généralement le point de départ pour de plus grandes évaluations précliniques de nouveaux agents antimicrobiens. Le but de la mesure de la concentration minimale inhibitrice est de s'assurer que les antibiotiques sont choisis efficacement pour augmenter le succès du traitement. (Wikipedia) Cuirs et peaux -- Conservation Peaux salées Sels de sodium Sophorolipides Index. décimale : 675 Technologie du cuir et de la fourrure Résumé : Sophorolipids (SLs) are fungal/yeast glycolipids that possess antimicrobial activity. In this study, three different SL mixtures were produced by microbial fermentation from oleic acid (SL-o), palmitic acid (SL-p), and stearic acid (SL-s), and tested for their antimicrobial activity against various halotolerant and moderately halophilic bacteria, and against extremely halophilic archaea that were isolated from salt and salted skin samples, as well as bacterial and extremely halophilic archaeal reference strains. The minimum inhibitory concentrations (MICs) of each of the SLs against known halotolerant and halophilic microorganisms were determined by the broth microdilution test method using resazurin dye. The extremely halophilic archaeal strains were most susceptible to the antimicrobial action of the tested SLs with MIC values as low as 3.42 μg/mL. Conversely, the endospore-forming halotolerant test strains, although susceptible to SLs, showed MIC values as high as 109.38 μg/mL. The SL-o, SL-p, and SL-s each exhibited broad-spectrum activity, demonstrating growth-inhibition against ten salt-associated bacterial strains and three archaeal strains possessing proteolytic activity, lipolytic activity, or both properties. In addition, each of the SLs showed growth-inhibition against three bacterial reference strains and two extremely halophilic archaeal reference strains. The findings from this study suggest that SL-o, SL-p, and SL-s might be utilized as potential antimicrobial agents together with salt, contributing to the preservation of the leather industry’s salted skins and hides. Note de contenu : - Materials - Production, isolation, purification, and analysis of sophorolipids - Inoculation procedure for test microorganisms - Preparation of resazurin solution - Determination of MICs of sophorolipid solutions and ethanol against test strains - Table 1 : Diacetylated lactone distribution for the sophorolipids used in this study produced from palmitic acid (SL-p), stearic acid (SL-s), and oleic acid (SL-o) according to their hydroxy fatty acid content - Table 2 : MIC values of SL-o, SL-p, SL-s (μg/mL) and ethanol (%) against halotolerant bacterial strains, moderately halophilic bacterial strains, bacterial reference strains, extremely halophilic archaeal strains, and extremely halophilic archaeal reference strains DOI : https://doi.org/10.34314/jwv5ae27 En ligne : https://drive.google.com/file/d/1k433IxtoIH-El2k7ndk5zFzUu1IH5J7w/view?usp=drive [...] Format de la ressource électronique : Pdf Permalink : https://e-campus.itech.fr/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=41287 [article]

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