Characterization and control of antibiotic-resistant calmati saltern's isolates with bacteriocins / Pinar Caglayan in JOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA), Vol. CXVII, N° 8 (08/2022)  

[article]  inJOURNAL OF THE AMERICAN LEATHER CHEMISTS ASSOCIATION (JALCA) > Vol. CXVII, N° 8 (08/2022) . - p. 315-329 Titre : Characterization and control of antibiotic-resistant calmati saltern's isolates with bacteriocins Type de document : texte imprimé Auteurs : Pinar Caglayan, Auteur Année de publication : 2022 Article en page(s) : p. 315-329 Note générale : Bibliogr. Langues : Américain (ame) Catégories : Bactéries -- Identification Bactéries -- Isolement Bactéries halophiles Bactériocines Les bactériocines sont une famille de peptides ou protéines synthétisés naturellement par certaines bactéries. Une bactériocine consiste généralement en un composé protéique de 20 à 60 acides aminés. Les bactériocines ne sont pas des antibiotiques mais elles possèdent des propriétés antibiotiques : - Elles peuvent être bactériocides, c'est-à-dire éliminer certains micro-organismes. - Elles peuvent être bactériostatiques, c'est-à-dire inhiber la croissance de certains micro-organismes. Caractérisation Concentration bactéricide minimale La concentration bactéricide minimale (CBM) est la plus faible concentration d'un agent antibactérien nécessaire pour tuer une bactérie particulière1. Elle peut être déterminée à partir des tests de concentration minimale inhibitrice (CMI) de dilution en bouillon en repiquant les bactéries sur des plaques d'agar qui ne contiennent pas l'agent antibactérien que l'on teste. La CBM est identifiée en déterminant la concentration la plus faible d'agent antibactérien qui réduit la viabilité de l'inoculum bactérien initial à un niveau supérieur ou égal à 99,9%. La CBM est complémentaire à la CMI ; alors que le test CMI indique le niveau le plus bas d'agent antimicrobien qui inhibe la croissance, le CBM indique le niveau le plus bas d'agent antimicrobien qui entraîne la mort microbienne. Cela signifie que même si une CMI particulière montre une inhibition, le repiquage des bactéries sur de la gélose peut encore entraîner la prolifération de l'organisme car l'antimicrobien n'a pas causé la mort. Les agents antibactériens sont généralement considérés comme bactéricides si la CBM ne dépasse pas quatre fois la CMI. Comme le test CBM utilise des unités formant colonies comme mesure indirecte de la viabilité bactérienne, il peut être biaisé par des agents antibactériens qui provoquent l'agrégation des cellules bactériennes. On peut citer en exemples les flavonoïdes et les peptides. (Wikipedia) Concentration minimale inhibitrice (antimicrobiens) En microbiologie, la concentration minimale inhibitrice (CMI) est la plus faible concentration d'un produit chimique, généralement un médicament, qui empêche la croissance visible d'une ou de plusieurs bactéries. La CMI dépend du micro-organisme considéré, de l'être humain affecté (in vivo uniquement) et de l'antibiotique lui-même. La CMI est déterminée en préparant des solutions du produit chimique in vitro à diverses concentrations croissantes, en incubant les solutions avec des groupes séparés de bactéries en culture et en mesurant les résultats en utilisant une méthode de dilution standardisée (agar ou microdilution). Les résultats se classent ensuite comme "sensible", "intermédiaire" ou "résistant" à un antimicrobien particulier en utilisant un point d'arrêt. Les points d'arrêt sont des valeurs convenues, publiées dans les directives d'un organisme de référence, comme le US Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), la British Society for Antimicrobial Chemotherapy (BSAC) ou le Comité européen sur les tests de sensibilité aux antimicrobiens (EUCAST). On a pu constater des écarts importants au niveau des points d'arrêt de divers pays européens au fil des ans, et entre ceux de l'EUCAST et du CLSI. Alors que la CMI est la concentration la plus faible d'un agent antibactérien nécessaire pour inhiber la croissance visible, la concentration bactéricide minimale (CBM) est la concentration minimale d'un agent antibactérien qui entraîne la mort bactérienne. Plus la CMI est proche de la CBM, plus le composé est bactéricide. La première étape de la découverte d'un médicament est souvent le dépistage d'un médicament candidat de banque de données pour les CMI contre les bactéries d'intérêt. En tant que tels, les CMI sont généralement le point de départ pour de plus grandes évaluations précliniques de nouveaux agents antimicrobiens. Le but de la mesure de la concentration minimale inhibitrice est de s'assurer que les antibiotiques sont choisis efficacement pour augmenter le succès du traitement. (Wikipedia) Microbiologie Résistances aux antibiotiques Sels de sodium Index. décimale : 675 Technologie du cuir et de la fourrure Résumé : Camalti Saltern is the largest solar saltern in Izmir, Turkey. The salt obtained from Camalti Saltern is used in food and leather industries to prevent bacterial growth. In this saltern, seawater is pumped into shallow ponds. Then, the sun and wind cause evaporation and crystallization, finally sea salt is produced. Due to the fact that Camalti Saltern contains various halophilic bacteria, the goals of the present study were to isolate and identify haloversatile bacteria from Camalti Saltern’s brine samples, to examine their antibiotic resistance profiles, to determine antimicrobial activities under optimum environmental conditions, to determine bacteriocin concentration by Bradford Method, to detect Minimum Inhibitory Concentrations (MIC) and Minimum Bactericidal Concentrations (MBC) of bacteriocins against multidrug-resistant isolates, and to observe the cell structure of bacteriocin-treated bacteria under SEM. Sixteen bacterial isolates were recovered from Camalti Saltern’s brine samples and were identified as 14 different species (Bacillus haynesii, Bacillus simplex, Bacillus subtilis subsp. stercoris, Bacillus pumilus,Staphylococcus petrasii subsp. jettensis, Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus, Kocuria sediminis, Rhodococcus enclensis, Marinobacter hydrocarbonoclasticus, Vibrio olivae, Marinomonas communis, Pseudomonas psychrotolerans, Salinivibrio costicola subsp. vallismortis, Vibrio neocaledonicus). Percentages of antibiotic resistance of isolates were 63% to aztreonam, 50% to amoxicillin/clavulanic acid, 44% to ampicillin, 44% to cefadroxil, 31% to imipenem, 19% to ampicillin/sulbactam, 6% to chloramphenicol, 6% to tetracycline, 6% to mupirocin, 6% to meropenem. The bacteriocin concentrations of Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis were measured as 1.02 mg/mL and 1.25 mg/mL, respectively. Bacteriocins of Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis, which were not resistant to any antibiotics tested,exhibited the inhibitory effect against Kocuria sediminis resistant to ten antibiotics and Bacillus pumilus resistant to four antibiotics. Bacteriocin of Salinivibrio costicola subsp. vallismortis also demonstrated the inhibitory effect against Pseudomonas psychrotolerans resistant to five antibiotics. Scanning electron micrographs showed that cell morphologies of bacteriocin-treated isolates (Kocuria sediminis, Bacillus pumilus, Pseudomonas psychrotolerans) were damaged. In conclusion, bacteriocins produced from the haloversatile Camalti saltern isolates may be used in the leather industry to prevent the growth of antibiotic-resistant haloversatile bacteria. Note de contenu : - Sample collection - Isolation of bacteria - Characterization of the isolates - Amplification and sequencing of 16S rRNA genes - Nucleotide accession number - Antibiotic susceptibility - Preparation of cell-free supernatant - Screening of antimicrobial activity among the test isolates - Determination of protein concentration using Bradford method - Optimum conditions for bacteriocin production from Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis - Effect of heat on bacteriocins produced by Rhodococcus enclensis and Salnivibrio costicola subsp. vallismortis - Effect of pH on bacteriocins produced by Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis - Effect of NaCl concentration on bacteriocins produced by Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis - Effect of enzymes (Proteinase K and Lipase) on bacteriocins produced by Rhodococcus enclensis and Salinivibrio costicola subsp. vallismortis - Minimum inhibitory concentrations and minimum bactericidal concentrations of bacteriocins against multidrug-resistant isolates - Preparation of bacteriocin-treated and bacteriocin-untreated cells for scanning electron microscopy - Table 1 : Characteristics of haloversatile bacteria isolated from brine samples of the Camalti Saltern - Table 2 : Inhibition zone diameter measurements (mm) of haloversatile bacteria isolated from brine samples of the Camalti Saltern - Table 3 : Inhibitory effect of bacteriocin produced by bacterial isolates against each other - Table 4 : Inhibition zone diameters (mm) of multidrug-resistant haloversatile bacteria against bacteriocins obtained from Rhodococcus enclensis, Salinivibrio Costicola subsp. vallismortis at different incubation temperatures, pH and NaC1 concentrations - Table 5 : The effects of different temperatures, pH, NaC1 concentrations, proteinase K and lipase enzymes on antibacterial effect of bacteriocins - Table 6 : The Minimum Inhibitory Concentrations of bacteriocin produced from Rhodococcus enclensis against Kocuria sediminis and Bacillus pumilus - Table 7 : The Minimum Inhibitory Concentrations of bacteriocin produced from Salinivibrio costicola subsp. vallismortis against Kocuria sediminis, Bacillus pumilus and Pseudomonas psychrotolerans DOI : https://doi.org/10.34314/jalca.v117i8.5982 En ligne : https://drive.google.com/file/d/1G3HZoIp4GH7W3A22JxMjjbmRimXH0dkk/view?usp=drive [...] Format de la ressource électronique : Pdf Permalink : https://e-campus.itech.fr/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=37824 [article]

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