Caractérisation de la flore microbienne associée aux phénomènes de corrosion marine : apport de la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) / Nicolas Boudaud in MATERIAUX & TECHNIQUES, Vol. 98, N° 1 (2010)  

[article]  inMATERIAUX & TECHNIQUES > Vol. 98, N° 1 (2010) . - p. 69-79 Titre : Caractérisation de la flore microbienne associée aux phénomènes de corrosion marine : apport de la spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) Type de document : texte imprimé Auteurs : Nicolas Boudaud, Auteur ; S. Pineau, Auteur ; C. Amiel, Auteur Année de publication : 2010 Article en page(s) : p. 69-79 Note générale : Bibliogr. Langues : Français (fre) Catégories : Caractérisation Corrosion Corrosion par l'eau de mer Fourier, Spectroscopie infrarouge à transformée de Microorganismes Index. décimale : 620.11 Matériaux (propriétés, résistance) Résumé : Une approche polyphasique a été utilisée pour étudier la flore cultivable anaérobie associée aux phénomènes de corrosion induite par les microorganismes (CIM). Parmi cette flore, les bactéries sulfato-réductrices (BSR) et les bactéries thiosulfato-réductrices (BTR) sont décrites comme étant particulièrement agressives vis-à-vis des matériaux métalliques immergés en eau de mer, notamment à cause de leur capacité à produire du sulfure de dihydrogène (H2S). Les spectres IR de 22 BSR et BTR de collection ont été enregistrés afin de créer une spectrothèque de référence. Pour ce faire, un milieu de culture minimum commun (MCM) a été développé afin de permettre la croissance concomitante des BSR et des BTR et de permettre la comparaison de leurs spectres IR. Les résultats de la classification IRTF de ces souches ont abouti à une discrimination nette au niveau genre et espèce. Les spectres IR d’isolats issus de coupons en acier carbone immergés durant une année dans 3 zones portuaires françaises ont été comparés à la spectrothèque préalablement créée. Leur identification et l’image de leur biodiversité ont été décrites en associant les résultats spectroscopiques et le séquençage du gène de l’ARN 16S de quelques souches représentatives. Dans cette étude, la population dominante est constituée de souches appartenant au genre Vibrio. Des souches appartenant aux genres Desulfovibrio (BSR) et à l’ordre des Clostridiales ont également été retrouvées. Dans l’ensemble, l’approche polyphasique combinant spectroscopie IRTF et méthode moléculaire a permis l’étude taxonomique et écologique de la flore bactérienne cultivable sur MCM associée à la CIM. Note de contenu : - Souches bactériennes utilisées pour la constitution de la spectrothèque de référence - Souches bactériennes isolées de l'environnement - Conditions de culture - Caractérisation morphologique, biochimique et moléculaire des isolats - Enregistrement et traitement statistique des spectres IR DOI : http://dx.doi.org/10.1051/mattech/2010013 En ligne : http://www.mattech-journal.org/articles/mattech/pdf/2010/01/mt09081.pdf Format de la ressource électronique : Pdf Permalink : https://e-campus.itech.fr/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=26414 [article]

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Mise en place d'une bibliothèque de spectres infrarouges de bactéries sulfato-réductrices et thiosulfato-réductrices / Nicolas Boudaud in MATERIAUX & TECHNIQUES, Vol. 93, Hors série (2005)  

[article]  inMATERIAUX & TECHNIQUES > Vol. 93, Hors série (2005) . - p. 147-154 Titre : Mise en place d'une bibliothèque de spectres infrarouges de bactéries sulfato-réductrices et thiosulfato-réductrices Type de document : texte imprimé Auteurs : Nicolas Boudaud, Auteur ; A. Carayon, Auteur ; C. Amiel, Auteur ; L. Mariey, Auteur ; J. Travert, Auteur Année de publication : 2006 Article en page(s) : p. 147-154 Note générale : Bibliogr. Langues : Français (fre) Catégories : Bactéries -- Identification Corrosion microbienne Spectrométrie infrarouge Tags : 'Bactéries  Sulfato-réductrices'  thiosulfato-réductrices'  'Spectroscopie  infraRouge  à  transformée  de  Fourier'  Caractérisation  'Corrosion  induite  par  les  microorganismes'  'Bibliothèques  spectres' Index. décimale : 535.8 Applications, spectroscopie Résumé : La présence de certaines bactéries au sein d'un biofilm peut soit accélérer un processus de corrosion déjà établi, soit créer des conditions favorables à son élaboration. Les microorganismes considérés à ce jour comme les plus agressifs pour les matériaux métalliques en milieu marin sont les Bactéries Sulfato-Réductrices (BSR) et Thiosulfato-Réductrices (BTR). Des travaux préliminaires ont montré les potentialités de la spectroscopie InfraRouge à Transformée de Fourier (IRTF) pour la discrimination de ces 2 groupes. La réalisation d'une bibliothèque de spectres de référence nécessite la mise en place de conditions de cultures standardisées communes à l'ensemble de la flore étudiée. Une première bibliothèque spectrale incluant 6 BSR et 6 BTR de collection a été élaborée. La classification hiérarchique de ces 12 souches permet d'obtenir 3 clusters distincts (un de BSR, un de BTR et un mixte), et de discriminer l'ensemble de ces souches au niveau genre (11 souches sur 12) et au niveau espèce (12 souches sur 12). Dix souches isolées de l'environnement ont été testées sur cette bibliothèque, et un début d'identification a pu être proposé. L'enrichissement de la base de données initiée sera poursuivi pour améliorer les capacités d'identification des bactéries sulfurogènes isolées de l'environnement marin. DOI : http://dx.doi.org/10.1051/mattech:2006013 En ligne : http://www.mattech-journal.org/articles/mattech/pdf/2005/03/MT06018.pdf Format de la ressource électronique : Pdf Permalink : https://e-campus.itech.fr/pmb/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=9702 [article]

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